学术论文免费查重软件主要有：1.萌创查重；2.CNKI查重；3.万方查重。这些软件都提供免费查重服务，用户可以将论文上传至平台进行查重。在使用时，首先注册账号，然后上传论文，等待系统分析结果即可。在查重结果中，会显示重复率和重复部分，帮助用户发现论文中的抄袭问题。

除了免费查重软件外，还有一些收费查重软件，如Turnitin、iThenticate等，这些软件具有更强大的查重功能和更准确的结果。在使用任何查重软件时，都应该注意保护个人隐私和论文版权，避免泄露个人信息和论文内容。另外，查重软件只是工具，最终的查重结果还需要用户结合实际情况进行分析和处理。